邢台市疾病预防控制中心成立于2003年2月，是由市政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益性全额事业单位。
办公室、财务科、免疫规划科、疾病控制科（应急办）、性病艾滋病防治科、结核病防治科、职业卫生科、消毒杀虫与公共卫生科、地方病防治科、慢性病防治科（门诊部、社区卫生服务站）、质量控制科、微生物检验科、理化检验科、情报信息科、健康教育科和生物制品供应科共16个科室。
市疾病预防控制中心是集疾病预防与控制、监测检验与评价、健康教育与促进、应用研究与指导、技术管理与服务为一体的专业性疾病预防控制机构。中心拥有液相色谱仪、气相色谱仪、原子吸收等大型设备60余台件，是我市经过省级计量认证的权威检验机构。尤其是艾滋病确证实验室是我市确诊艾滋病的唯一权威机构。最近建成的分子生物学实验室，是全国流感监测网络成员实验室之一。
“十一五”期间，市疾控中心坚持预防为主的卫生工作方针，开拓进取，不断创新，出色地完成了各项工作任务。在四川震后卫生防疫、奥运公共卫生保障、手足口病防控、艾滋病结核病防治等工作中都做出了积极的贡献。
先后荣获了省卫生厅和省疾控中心授予的“河北省卫生系统赴川抗震救灾先进集体”、“奥运公共卫生保障工作先进单位”、“全省医药卫生系统先进集体”等荣誉称号。
2020年11月，入选第六届全国文明单位名单。